Vladimir S. Naumov


Ph.D. student, Department of Chem­istry, Uni­ver­si­ty of Nizh­ny Nov­gorod

CONTACTS

RESEARCH INTERESTS

  • mol­e­c­u­lar dynam­ics sim­u­la­tions
  • force fields param­e­triza­tion
  • GROMOS force fields
  • bio­log­i­cal poly­mers: chi­tosan, insulin, RNA
  • dis­so­lu­tion and aggre­ga­tion of bio­log­i­cal poly­mers

SOFTWARE: Gauss­ian, DFTB Plus, Gromacs, Plumed, Moltran, Chem­Craft, VMD

PROGRAMMING LANGUAGES: For­tran, Python

PUBLICATIONSINTERSHIPS, AWARDS, GRANTS

  • Pub­li­ca­tions: 22 (2 paper)
  • Intern­ships: 2 (1 joint vis­it)
  • Awards: 2
  • Grants: 4

Publications 2018

  • Nau­mov, V. S. & Igna­tov, S. K.  Dis­so­lu­tion of chi­tosan nanocrys­tals in aque­ous media of dif­fer­ent acid­i­ty. Mol­e­c­u­lar dynam­ic study // Car­bo­hy­drate Poly­mers, 207, 619–627. doi:10.1016/j.carbpol.2018.12.019 (DOWNLOAD PDF)
  • Наумов В.С, Игнатов С.К. Растворение полиаминогликанов в водных средах. Влияние кислотности среды и молекулярной массы полимера на кинетику растворения. Молекулярно-динамическое исследование // Современная химическая физика XXIX Симпозиум, 16–27 сентября 2018 года, г. Туапсе / Сборник тезисов – 2018 г., стр. 103
  • Авдошин А.А., Наумов В.С., Игнатов С.К. Определение термодинамических и кинетических характеристик координации олигомеров хитозана с инсулином методами молекулярной динамики. Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул. // IX Всероссийская молодежная школа-конференция, Иваново, 19–23 ноября 2018 / Cборник научных статей — стр. 21–24
  • С.В. Захаров, А.А. Авдошин, В.С. Наумов, С.К. Игнатов Диффузионные свойства аморфного полилактида. Молекулярно-динамическое исследование. Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул. // IX Всероссийская молодежная школа-конференция, Иваново, 19–23 ноября 2018 / Cборник научный статей — стр. 83–85

Internships, Awards, Grants 2018

  • Par­tic­i­pant of RFBR Project 17–03-00912 “Сatal­y­sis on chem­i­cal­ly mod­i­fied bimetal­lic nanopar­ti­cles of plat­inum-rhodi­um: the mech­a­nism and ways for increas­ing of selec­tiv­i­ty in the hydro­gena­tion of bifunc­tion­al com­pounds”
  • Par­tic­i­pant of RFBR Project 18–33-00721 “The devel­op­ment of the hybrid mate­ri­als for drug deliv­ery sys­tems based on gold nanopar­ti­cles func­tion­al­ized by the bio­mark­ers”
  • Par­tic­i­pant of RFBR Project 18–43-520012 “Devel­op­ment of meth­ods and soft­ware for pre­dic­tions of physi­co-chem­i­cal prop­er­ties func­tion­al nano­ma­te­ri­als”
  • Joint vis­it to CMS and HMI groups of Bre­men Cen­ter for Com­pu­ta­tion­al Mate­ri­als Sci­ence Novem­ber 1 – Decem­ber 15, 2018
  • Win­ner of the schol­ar­ship of aca­d­e­mi­cian G.A. Razu­vaev for the 2018–2019 aca­d­e­m­ic year

Publications 2017

  • Nau­mov, V.S. & Igna­tov, S.K. Mod­i­fi­ca­tion of 56ACARBO force field for mol­e­c­u­lar dynam­ic cal­cu­la­tions of chi­tosan and its deriv­a­tives // J Mol Mod­el (2017) 23: 244. https://doi.org/10.1007/s00894-017‑3421-x (DOWNLOAD PDF)
  • Наумов В.С., Игнатов С.К., Авдошин А.А. Растворение и ассоциация биологических полимеров в водных средах различной кислотности. Молекулярно-динамическое исследование // Современная химическая физика XXIX Симпозиум, 17–28 сентября 2017 года, г. Туапсе / Сборник тезисов – 2017 г., стр. 220
  • V.S.Naumov, A.S. Logi­no­va, S.K. Igna­tov, T. Frauen­heim Struc­ture and elec­tron­ic prop­er­ties of poly­mer­ic com­pos­ites based on tita­ni­um diox­ide nanopar­ti­cles. DFT and DFTB study // 6-th School-Con­fer­ence on Atom­istic Sim­u­la­tion of Func­tion­al Mate­ri­als (ASFM 2017 Win­ter), 7–8 Decem­ber 2017, Moscow / Book of Abstracts. – 2017, p. 26
  • А.А. Авдошин, В.С. Наумов, С.К. Игнатов ОПРЕДЕЛЕНИЕ ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИХ И КИНЕТИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК КООРДИНАЦИИ ОЛИГОМЕРОВ ХИТОЗАНА С ИНСУЛИНОМ МЕТОДАМИ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ // Всероссийская конференция по квантовой и математической химии (Уфа, 13–17 ноября 2017 г.): сб. тез. докл. / под ред. С.Л. Хурсана. ¬– Уфа: Изд-во УГНТУ, 2017. – стр. 27

Internships, Awards, Grants 2017

  • Par­tic­i­pant of RFBR Project 17–03-00912 “Сatal­y­sis on chem­i­cal­ly mod­i­fied bimetal­lic nanopar­ti­cles of plat­inum-rhodi­um: the mech­a­nism and ways for increas­ing of selec­tiv­i­ty in the hydro­gena­tion of bifunc­tion­al com­pounds”

Publications 2016

  • В.С. Наумов, А.А. Авдошин, С.К. Игнатов Растворение и ассоциация хитозана и его комплексообразование с белковым субстратом. Молекулярно-динамическое исследование // Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2016, 24–25 мая, Москва / Тезисы докладов летней сессии (ASFM2016-1)­ ­­- 2016 г., стр. 17
  • А.В. Рожков, В.С. Наумов, С.К. Игнатов Кинетика диффузионных режимов реакций окиcлителей в кристаллах льда. Исследование методами молекулярной динамики и кинетического Монте-Карло // Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2016, 24–25 мая, Москва / Тезисы докладов летней сессии (ASFM2016-1) — 2016 г., стр. 21
  • V.S. Nau­mov, A.A. Avdoshin, S.K. Igna­tov Dis­so­lu­tion and asso­ci­a­tion of chi­tosan and its com­plex­a­tion with pro­tein sub­strate. Mol­e­c­u­lar dynam­ics study // Inter­na­tion­al School-Sem­i­nar on Com­put­er-Aid­ed Mol­e­c­u­lar Design may 18–20, 2016 Kazan, Rus­sia / Book of Abstracts and Sci­en­tif­ic Pro­gram — 2016 г., стр. 47
  • Наумов В.С., Игнатов С.К. Молекулярно-динамическое моделирование растворения кристалла хитозана: влияние кислотности среды и размеров полимера на кинетику растворения // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров / Сборник материалов — 2016 г., стр. 121–122
  • Авдошин А.А., Наумов В.С., Игнатов С.К. Молекулярно-динамическое исследование систем хитозана с инсулином // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров / Сборник материалов — 2016 г., стр. 117–118
  • Anas­tasiya S. Logi­no­va, Vladimir S. Nau­mov, Evgeniya V. Salo­mati­na, Lar­isa A. Smirno­va, Stanislav K. Igna­tov Struc­ture and ther­mo­dy­nam­ic, elec­tron­ic and spec­tral prop­er­ties of pho­to­cat­a­lysts based on the TiO2/HEMA nanocom­pos­ites. A DFT and DFTB study // Com­pu­ta­tion­al insight into pho­to-induced process­es at inter­faces Octo­ber 10th ­– 14th 2016 Bre­men Cen­ter for Com­pu­ta­tion­al Mate­ri­als Sci­ence Uni­ver­si­ty of Bre­men – 2016, page P23

Internships, Awards, Grants 2016 

  • Par­tisi­pant of RFBR Project 14–03-00585 “Ele­men­tary het­ero­ge­neous-cat­alyt­ic reac­tions on chem­i­cal­ly mod­i­fied nanopar­ti­cles of plat­inum and VIII group met­als: selec­tive hydro­gena­tion of bifunc­tion­al com­pounds”
  • Vis­it to CMS group of Bre­men Cen­ter for Com­pu­ta­tion­al Mate­ri­als Sci­ence Octo­ber 10 – Novem­ber 10, 2016
  • Диплом II степени Наумов Владимир Сергеевич // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров

Other 2016

  • Сертификат участника Наумов Владимир Сергеевич // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров
  • Cer­tifi­cate of par­tic­i­pa­tion Vladimir Nau­mov // Inter­na­tion­al School-Sem­i­nar on Com­put­er-Aid­ed Mol­e­c­u­lar Design may 18–20, 2016 Kazan, Rus­sia
  • Сертификат участника Наумов Владимир Сергеевич //  Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2016, 24–25 мая, Москва
  • Con­fir­ma­tion Let­ter that Vladimir S. Nau­mov have par­tic­i­pat­ed in CECAM-Work­shop “Com­pu­ta­tion­al insight into pho­to-induct­ed process at inter­faces” and been guest at BCCMS for one month from Octo­ber 10th until Novem­ber 10th, 2016

Publications 2015

  • Наумов В.С., Игнатов С.К. РАСТВОРЕНИЕ НАНОКРИСТАЛЛОВ ПОЛИАМИНОГЛИКАНОВ В ВОДНЫХ РАСТВОРАХ. МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ  ИССЛЕДОВАНИЕ // «Квантово-xимические расчеты: структура и реакционная  способность органических и неорганических  молекул» VII Всероссийская молодежная  школа-конференция. Сборник статей. – Иваново,  14–17 апреля 2015 г. – стр. 206–207.
  • Наумов В.С., Игнатов С.К. РАСТВОРЕНИЕ И АССОЦИАЦИЯ ПОЛИАМИНОГЛЮКАНОВ В ВОДНЫХ РАСТВОРАХ РАЗЛИЧНОЙ КИСЛОТНОСТИ МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // Международный научный форму «Бутлеровское наследие ­– 2015». – Казань, 17–22 мая 2015 г.

Internships, Awards, Grants 2015 

  • Par­tisi­pant of RFBR Project 14–03-00585 “Ele­men­tary het­ero­ge­neous-cat­alyt­ic reac­tions on chem­i­cal­ly mod­i­fied nanopar­ti­cles of plat­inum and VIII group met­als: selec­tive hydro­gena­tion of bifunc­tion­al com­pounds”

Publications 2014

  • В.С. Наумов, С.К. Игнатов, А.Г. Разуваев, И.А. Глазова, А.Е. Мочалова Структура и растворимость аминозамещенных полигликанов в воде. Молекулярно-динамическое исследование // VIII Всероссийская конференция с международным участием молодых ученых по химии «Менделеев — 2014» Тезисы докладов. – Санкт-Петербург, 1–4 апреля 2014 г. – стр. 69–70.
  • Наумов В.С., Игнатов С.К., Разуваев А.Г. МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПРОЦЕССА РАСТВОРЕНИЯ НАНОКРИСТАЛЛА ХИТОЗАНА В ВОДЕ // Математика и математическое моделирование Сборник материалов VIII Всероссийской молодежной научно-инновационной школы.  – Саров,  8–11 апреля 2014 г. – стр. 90.
  • В.С. Наумов, С.К. Игнатов, А.Г. Разуваев РАСТВОРЕНИЕ НАНОКРИСТАЛЛА ХИТОЗАНА В ВОДНЫХ СРЕДАХ РАЗЛИЧНОЙ КИСЛОТНОСТИ // Физические процессы в биологических системах. Всероссийская Интернет-конференция с международным участием. Материалы конференции. – 11 июня 2014 г. – стр. 45–47.
  • В.С. Наумов, С.К. Игнатов, А.Г. Разуваев,  А.Е. Мочалова, И.А. Глазова, Л.А. Смирнова СТРУКТУРА И РАСТВОРИМОСТЬ НАНОКРИСТАЛЛОВ ПОЛИАМИНОГЛИКАНОВ В ВОДЕ. МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // Материалы XII международной конференции «Современные перспективы в исследовании хитина и хитозана». – Пермь, 23–28 июня 2014 г. – стр. 260–265.
  • V.S. Nau­mov,  S.K. Igna­tov,  A.G. Razu­vaev,  A.E. Mochalo­va,  I.A. Glazo­va,  L.A. Smirno­va SOLUBILITY AND STRUCTURE OF CHITOSAN IN AQUEOUS MEDIA OF VARIOUS ACIDITY. MOLECULAR DYNAMIC STUDY // Inter­na­tion­al Con­fer­ence «Mol­e­c­u­lar Com­plex­i­ty in Mod­ern Chem­istry MCMC-2014» Book of Abstracts. – Moscow, 2014 Sep­tem­ber 13–19. – P. 220.
  • Наумов В.С., Игнатов С.К. РАСТВОРЕНИЕ НАНОКРИСТАЛЛИЧЕСКОГО ХИТОЗАНА В ВОДНОЙ СРЕДЕ: МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // «Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2014» Школа-конференция Тезисы докладов. – Москва, 9–10 Декабря 2014 г. – стр. 29.

Internships, Awards, Grants 2014 

  • Par­tisi­pant of RFBR Project 14–03-00585 “Ele­men­tary het­ero­ge­neous-cat­alyt­ic reac­tions on chem­i­cal­ly mod­i­fied nanopar­ti­cles of plat­inum and VIII group met­als: selec­tive hydro­gena­tion of bifunc­tion­al com­pounds”

Комментарии запрещены.